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华大海洋“鱼类抗菌肽数据库”上线, 助力海洋药物研发
日期:2020-07-15

近日,华大海洋构建的“鱼类抗菌肽数据库”正式在其官网上线。作为一个专业且相对完整的数据库,“鱼类抗菌肽数据库”拥有4000余条详细序列,为深入研发新型饲料添加剂、保健食品或药品等提供重要的科技支撑。 

九年来,在海洋863子课题、深圳市未来产业专项、深圳市科技计划国际合作研究项目、大鹏新区产业发展专项、深圳市院士工作站等经费支持下,华大海洋研究院院长石琼教授率领团队长期开展多肽类海洋药物研发,重点关注芋螺毒素和抗菌肽。 

抗菌肽(Antimicrobialpeptide;AMP)是一类具有抗菌活性的生物来源多肽,可抑制广谱细菌、真菌、原虫、病毒及癌细胞等,是替代抗生素、解决耐药性问题的重要物质。

鱼类种类繁多,是开发抗菌肽资源的重要宝库。华大海洋结合大数据来开展抗菌肽序列的高通量筛选,以期研发鱼类来源的抗菌肽型饲料添加剂和保健食品。

新建的“鱼类抗菌肽数据库”由“抗菌肽参考数据库”(涉及参考序列近3000条;excel表展示)、“鱼类抗菌肽序列”(包括1000余条由华大海洋从弹涂鱼、海马、石斑鱼、罗非鱼等鱼类基因组种鉴定得到的非冗余候选抗菌肽序列;excel表展示)、“鱼类抗菌肽基因”(从11个代表性鱼类物种的基因组序列中鉴定出的近4500个候选基因)、“活性抗菌肽实例”(肝素结合性表皮生长因子Hbβ1和胰淀素amylin)以及“相关成果”(发表文章、申请专利)等五大部分组成。